Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ClgnP52194 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ClgnP52194 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms