Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxc13P50207 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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