Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Prpf38a-201ENSMUST00000079213 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Snap25-201ENSMUST00000028727 2116 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rpl19-ps2-201ENSMUST00000219540 590 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm6341-201ENSMUST00000119683 411 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Taar7c-ps-201ENSMUST00000122123 1055 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm9825-201ENSMUST00000178598 843 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Tex43-201ENSMUST00000035640 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprmP28828 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm7158-201ENSMUST00000120079 903 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm6298-201ENSMUST00000122262 981 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rpl6l-201ENSMUST00000171120 871 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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PtprmP28828 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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