Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms