Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Zcchc12-201ENSMUST00000048067 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pcdhb6-201ENSMUST00000061717 3729 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Kcnk2-201ENSMUST00000079451 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Vpreb1P13372 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms