Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxb4P10284 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms