Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lnx1O70263 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lnx1O70263 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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