Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm2056J3QQ02 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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