Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm6880A3KG45 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm6880A3KG45 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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