Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
Cldn34c4A2ANA3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms