Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChmQ9QXG2 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChmQ9QXG2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms