Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Tlr5Q9JLF7 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tlr5Q9JLF7 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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