Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Upk3aQ9JKX8 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Upk3aQ9JKX8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Upk3aQ9JKX8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Upk3aQ9JKX8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Upk3aQ9JKX8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Upk3aQ9JKX8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Upk3aQ9JKX8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Upk3aQ9JKX8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Upk3aQ9JKX8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Upk3aQ9JKX8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Upk3aQ9JKX8 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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