Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trim2Q9ESN6 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trim2Q9ESN6 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms