Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Pop5Q9DB28 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Pop5Q9DB28 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pop5Q9DB28 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms