Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Nop56Q9D6Z1 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nop56Q9D6Z1 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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