Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Khdc3Q9CWU5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms