Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Use1Q9CQ56 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Use1Q9CQ56 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms