Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Q9CPS8 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Q9CPS8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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