Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Syna-201ENSMUST00000149604 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm22987-201ENSMUST00000122757 246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20924-201ENSMUST00000177663 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20816-201ENSMUST00000177765 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20909-201ENSMUST00000178234 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20825-202ENSMUST00000178396 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf17Q99MV7 Gm20867-201ENSMUST00000178900 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms