Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ciao1Q99KN2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ciao1Q99KN2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms