Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
ApofQ91V80 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
ApofQ91V80 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms