Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3F2

Mmp21, Matrix metalloproteinase-21, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp21Q8K3F2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mmp21Q8K3F2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mmp21Q8K3F2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mmp21Q8K3F2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Mmp21Q8K3F2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Mmp21Q8K3F2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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