Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms