Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pramef8Q8CE24 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms