Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc63Q8CDV6 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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