Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms