Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift57Q8BXG3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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