Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SnupnQ80W37 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms