Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ClmQ7TSN2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms