Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rcbtb2-201ENSMUST00000022702 2971 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Kcnf1Q7TSH7 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kcnf1Q7TSH7 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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