Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Zbtb40Q6PCS8 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms