Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PtprdQ64487 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprdQ64487 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.2 ms