Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
E130208F15RikQ3UPV3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms