Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rnf149Q3U2C5 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rnf149Q3U2C5 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms