Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc39dQ0VF76 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms