Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Fank1-202ENSMUST00000121560 475 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm7158-201ENSMUST00000120079 903 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm42764-201ENSMUST00000197835 741 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm12376-201ENSMUST00000120538 607 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm7180-201ENSMUST00000121753 513 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm25687-201ENSMUST00000175442 241 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm9637-201ENSMUST00000179141 873 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tex43-201ENSMUST00000035640 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Gm10120-201ENSMUST00000219845 357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TrioQ0KL02 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms