Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm11800-201ENSMUST00000120050 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc21bQ0HA38 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms