Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Grin2cQ01098 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms