Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pde1bQ01065 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pde1bQ01065 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms