Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Rps29P62274 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms