Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxc13P50207 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hoxc13P50207 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Hoxc13P50207 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxc13P50207 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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