Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm5092-201ENSMUST00000188185 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Cct7-203ENSMUST00000204592 1544 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Tox-201ENSMUST00000039987 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm38258-201ENSMUST00000191792 675 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprmP28828 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprmP28828 Gm43246-201ENSMUST00000197597 564 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprmP28828 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Nps-203ENSMUST00000210907 1206 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm28905-202ENSMUST00000219328 1377 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm14686-201ENSMUST00000119926 343 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprmP28828 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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