Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RarbP22605 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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RarbP22605 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RarbP22605 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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