Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P20040 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P20040 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P20040 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P20040 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P20040 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P20040 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P20040 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P20040 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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