Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou4f1P17208 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms