Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb2P13373 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms