Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01676 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01676 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01676 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms