Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm2056J3QQ02 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms