Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Brpf3B2KF05 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms